Águas Mornas är en kommun i Brasilien. Den ligger i delstaten Santa Catarina, i den södra delen av landet, 1,300 km söder om huvudstaden Brasília. Antalet invånare är 5,546.
I omgivningarna runt Águas Mornas växer i huvudsak städsegrön lövskog. Runt Águas Mornas är det ganska glesbefolkat, med 38 invånare per kvadratkilometer. Klimatet i området är fuktigt och subtropiskt. Årsmedeltemperaturen i trakten är 17 °C. Den varmaste månaden är februari, då medeltemperaturen är 21 °C, och den kallaste är juli, med 12 °C. Genomsnittlig årsnederbörd är 1,826 millimeter. Den regnigaste månaden är februari, med i genomsnitt 232 mm nederbörd, och den torraste är maj, med 71 mm nederbörd.